La serie completa è composta da 40 episodi.
I titoli in rosso sono quelli proposti nella serie televisia originale italiana TV-ITB.
Quelli in giallo sono riferiti alla serie prodotta dalla Yamato Video, mentre quelli in blu sono quelli proposti nella edizione Dynit.

Si narra che molto tempo fa Atlantis si trovasse nell'Oceano Atlantico e Mur nell'Oceano Pacifico; inoltre, l'antica leggenda racconta che i due imperi scomparvero in mare in una sola notte. Ma nessuno sa che in quella notte ci fu anche un'altra terribile catastrofe che sconvolse un terzo impero.

Curiosità:

• La protagonista di questo episodio è sicuramente Reika, che - con la forza del suo amore - riuscirà a salvare Banjo dal potere telecinetico dell'Imperatore di Lumis.
• Viene mostrato per la prima volta il sottomarino Marine Antoniette.
• L'imperatore dell'antico impero di Lumis, Achilles, ha la facoltà di leggere nel pensiero.
• L'attacco solare del Daitarn 3 si rivela inutile contro il Megaborg.
• Questo è uno dei rari epidodi in cui viene utilizzata la Daitarn ragnatela.

	Il generale Damdes era un ufficiale dell'antico Impero di Lumis. Adesso, in combutta con i Meganoidi, vuole impadronirsi della Terra e sottomettere gli esseri umani con il soprannaturale potere del popolo di Lumis.
	Megaborg: Damdes Altezza: 148 metri Peso: 888 tonnellate Potenza: 81.800.000 cavalli Armi: Sulle sue spalle sono disposte lunghe lame che scaglia durante i combattimenti. Il calore che può emanare il suo corpo riesce quasi a sciogliere il Daitarn 3.

Minamoto era un assistente del professor Haran e dopo anni di ricerca è riuscito a creare il primo cyborg privo della propria volontà. Ricercato dai Meganoidi che lo vogliono costringere a creare un esercito di soldati perfetti, fugge sulla Terra per chiedere aiuto a Banjo.

Curiosità:

• Questo episodi, insieme al n. 12, è l'unico che ci consente di intravedere cosa nasconda il passato di Banjo. Scopriamo infatti quel è la ragione che lo spinge a combattere i meganoidi così ferocemente ed anche il motivo per cui suo padre è stato ucciso dai cyborgs da lui costruiti.
• Banjo usa la lama di energia generata dalla parte finale delle ali della Match Patrol in configurazione astronave.
• La sequenza in cui Banjo, anche se per scherzo, punta la pistola contro Minamoto - colpevole di aver continuato a costruire i robot nemici - ci mostra quanto profondo sia ancora il suo dolore.
• Durante la trasformazione in Daitarn 3, il megaborg attacca l'astronave e la cabina di pilotaggio, con dentro Minamoto, viene scagliata all'esterno.
• Il Daitarn 3 usa per la prima volta volta la "Daitarn esplosione" per liberarsi del Megaborg che lo ha avvolto.

	Il combattente speciale è un meganoide costruito dal signor Minamoto per servire Don Zauker.
	Il Megaborg combattente speciale è in grado di modificare liberamente il suo aspetto. La sua lancia può traformarsi in frusta allungando le due estremità ed ha la capacità di generare corrente ad alta tensione.
	I tentacoli della Macchina della Morte emettono un liquido capace di corrodere e sciogliere qualasiasi cosa.

Mentre Banjo, Reika, Beauty e Toppy si trovano al comando del Rabbit (il prototipo di un veicolo per il turismo spaziale della Beauty Company) durante il viaggio di collaudo, il veicolo viene misteriosamente attratto dalla Luna sulla cui superficie, Banjo ed i suoi amici notano enormi colline costituite da una lunghissima catena di dischi taglienti. A cosa potrà mai servire una simile attrezzatura?

Curiosità:

• Mentre il comandante spiega ai suoi superiori la sua strategia "affetta Terra", Don Zauker ha un'espressione stupita. Ma come è possibile se è effettivamente in in uno stato di catalessi?
• Il Rabbit è al suo settimo tentativo (i primi sei non sono andati a buon fine) di raggiungere la Luna.
• Il Rabbit viene agganciato alla gigantesca calamita e non riesce a liberarsi, ma l'auto che Banjo e compagni utilizzano per uscire dall'astronave non sembra risentire dell'attrazione magnetica.
• Il Daitarn arriva in pochi istanti sulla Luna (dal Giapppone)...
• Banjo, poco prima della fine del combattimento, chiama il Megaborg per nome e poi gli chiede come si chiama.
• La tenacia del comandante e l'insolito attacamento ai suoi subalterni fanno commuovere Banjo.

	Il comandate Buncher è il capo meganoide che cova l'ingenua speranza di tagliare in due la Terra. Per portare a termine la sua missione gli sono stati affidati solamente 2 soldati a cui tiene particolarmente.
	Il megabor Buncher può generare corrente elettrica ad alto voltaggio e scagliare missli.

Koros ha sentito tanto parlare del grande Haran Banjo, ma lo ricorda solo come un pauroso ragazzo fuggito da Marte. Per capire chi è realmente, non puo fare altro che affrontarlo personalmente.

Curiosità:

• Banjo e Koros si incontrano per la prima volta (da quando Banjo fuggì da Marte molti anni prima).
• Toppy usa uno speciale razzo per distruggere la base di Koros all'interno del varco iperdimensionale.
• Anche Beauty e Reika utilizzano un veicolo speciale per andare nello spazio.
• Koros utilizza 2 meganoidi dalle sembianze di Beauty e Reika per attirare Banjo in una trappola.

	Gli assistenti di Koros sono meganoidi che aiutano il loro superiore nel momanto in cui questo decide di assumere il comando dell'operazione.
	La Super Macchina della Morte utilizzata da Koros in questa missione è in grado di sparare raggi laser dalla bocca e difendersi dagli attacchi del nemico creando una barriera a forma di tela di ragno.